MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA

Tipologia: Struttura Complessa

Direttore

Descrizione Attività

La Struttura Complessa di Microbiologia e Virologia esegue saggi in ambito microbiologico e infettivologico per la diagnosi di patologie infettive sia per pazienti ricoverati che per utenti esterni afferenti ai centri prelievi aziendali, case di Comunità, Carceri (PO San Paolo e PO San Carlo) e in regime di convenzione con Enti Pubblici e Privati.

Il laboratorio partecipa a programmi di VEQ sia Regionali (CRC MedLab) che Internazionali (UK-NEQAS) L’attività si svolge principalmente nel laboratorio del PO San Paolo e in aree decentrate in modalità POCT (Point of Care Testing). Il laboratorio svolge attività di raccolta dati epidemiologici nell’ambito della sorveglianza e prevenzione delle infezioni da patogeni multiresistenti. Collabora con l’Università degli Studi di Milano essendo parte della rete formativa della Scuola di Specializzazione in Microbiologia e Virologia, partecipando quindi attivamente alla formazione degli specializzandi e alla ricerca clinica.

Il laboratorio è inserito nell’HUB NGS Facility dell’ASST Santi Paolo e Carlo per saggi di sequenziamento di patogeni per resistenze farmacologiche e attività di sorveglianza, svolge inoltre attività diagnostica e di screening delle Malattie Sessualmente Trasmesse per le quali l’Ambulatorio di Malattie Infettive della ASST è Centro di Riferimento Regionale.

In questo ambito effettua la Genotipizzazione di ceppi di HPV (Papilloma Virus Umano) ad alto rischio oncogeno per ATS Milano (screening di 70.000 campioni/anno) e per gli Ambulatori di Ginecologia e di Malattie Infettive aziendali. La SC è coinvolta attivamente nel progetto “MiCrobiota –gut-brain Axis in resistant Epilepsy (CARE) – PNRR-MCNT2-2023-12377646, finanziato dall’Unione Europea – Next Generation EU.

Nelle 3 Aree del Laboratorio si eseguono prestazioni diversificate per patologie utilizzando metodologie diagnostiche dedicate.

Area Batteriologia e Parassitologia:

Screening colturali e molecolari su materiali e distretti vari quali:
emocolture*,
liquor**,
espettorati,
broncolavaggi*,
broncoaspirati*,
pus,
biopsie,
liquidi biologici,
urine,
feci,
tamponi di sorveglianza (per CRE, MRSA e Lieviti in particolare C.auris).

Ricerca antigeni:

Legionella*,
Pneumococco*,
GDH*,
Rotavirus,
Adenovirus,
H.pylori,
RSV*,
Malaria**
Ricerca genoma* ed esame colturale del Bacillo di Koch (Tubercolosi attiva),
Ricerca parassiti: da campione di feci, urine, sangue. (* 8:00 – 20:00 / **h24).

Area Sierolgia e Immunodiagnostica:

screening e diagnosi sierologica di patologie infettive batteriche, virali e parassitarie,
Epatite acuta (anche in regime d’urgenza H12) e pregressa A, B, C, D, E,
infezioni respiratorie,
sifilide e infezioni trasmissibili in gravidanza (ToRCH),
infezione da HIV 1/2,
screening post vaccinale,
IGRA test per Tubercolosi latente (QFT-TB)
Screening in urgenza per l’idoneità del potenziale donatore di organi e tessuti e del paziente fonte di rischio biologico (H24).

Area diagnostica Molecolare:

screening e diagnosi molecolare di patologie infettive sia batteriche che virali,
diagnosi infezione acuta e monitoraggio terapeutico per HIV, HCV e HBV,
ricerca genomi virali in materiale respiratorio,
sangue e liquor (virus Erpetici, virus Influenzali, JCV)
ricerca genomi di Chlamydia trachomatis,
Neisseria gonorrhoeae,
Mycoplasma genitalium,
Trichomonas vaginalis su materiali urogenitali
Screening e diagnosi differenziale delle infezioni da SARS-CoV-2 e Influenza A e B anche in regime d’urgenza (H12) e screening di SARS-CoV-2 per il donatore d’organi (H24)

Il settore è coinvolto nel progetto regionale per la Sorveglianza di infezioni respiratorie acute/gravi nei PS nell’ambito di PANFLU.

Principali Patologie e Trattamenti

Patologie infettive respiratorie batteriche e virali sostenute da:

Batteri Gram Positivi (es S.aureus, S.pneumoniae) e Gram Negativi (es. E.coli, K.pneumoniae, P.aeruginosa, A.baumannii), da SARS CoV-2 , da Virus Influenzali e Virus Erpetici ,M. tubercolosis complex e NTM
Meningo-encefaliti virali
Meningiti batteriche
Batteriemie
Setticemie
Infezioni sistemiche gravi
Patologie dei tessuti molli sostenute da Batteri aerobi (es. S.aureus, Streptococchi Gruppo A) ed anaerobi (es. Bacteroides, Clostridium)
Infezioni delle vie urinarie
Infezioni extra polmonari Tubercolari e NTM
Malattie sessualmente trasmesse
Infezioni trasmissibili in gravidanza
Infezione cronica da HIV 1/2 con sequenziamento delle resistenze a farmaci antiretrovirali
Infezione attiva/cronica da HCV e HBV
Malattie Autoimmuni sistemiche (MAIS)
Malattie Autoimmuni Organo-Specifiche (MAOS)

Il laboratorio presta la sua attività H24 7/7 giorni

In regime di reperibilità per urgenze dalle ore 20.00 alle ore 8.00

I punti prelievo sono accessibili da Lunedì a Sabato dalle ore 7.30 alle ore 10.00

Rovito R, Bono V, Coianiz N, Cazzetta V, Franzese S, Mikulak J, Di Vito C, Bai F, Beaudoin-Bussières G, Tauzin A, Augello M, Tincati C, Santoro A, Borghi E, Marozin S, Finzi A, Della Bella S, Mavilio D, Marchetti G; EuCare Study Group. Multi-layered deep immune profiling, SARS-CoV-2 RNAemia and inflammation in unvaccinated COVID-19 individuals with persistent symptoms. Commun Med (Lond). 2025 May 5;5(1):155. doi: 10.1038/s43856-025-00832-8.
Marozin S, Bono V, Mazzoccoli M, Augello M, Rovito R, Taramasso L, Di Biagio A, Callegaro A, Maggiolo F, Borghi E, Tincati C, Marchetti G. Comparable gut mucosal breakdown and microbial translocation in severe COVID-19 with and without HIV infection. AIDS. 2025 Jun 1;39(7):921-923. doi: 10.1097/QAD.0000000000004166.
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Rovito R, Bono V, Augello M, Tincati C, Mainoldi F, Beaudoin-Bussières G, Tauzin A, Bianchi S, Hadla M, Yellenki V, d'Arminio Monforte A, Casola S, Borghi E, Finzi A, Marchetti G. Association between SARS-CoV-2 RNAemia and dysregulated immune response in acutely ill hospitalized COVID-19 patients. SCI REP. 2022 Nov 16;12(1):19658. doi: 10.1038/s41598-022-23923-1
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